出入境检验检疫管理职责和队伍已划入海关。４月２０日起，该系统将统一以海关名义对外开展工作，一线旅检、查验和窗口岗位均要统一上岗、统一着海关制服、统一佩戴关衔。

海关总署署长倪岳峰要求，尽快实现海关原有管理职责和检验检疫管理职责的深度融合、有机融合，达到“１＋１﹥２”的效果。具体而言，他要求确保４月２０日起旅检监管、通关作业申报查验放行“三个一”（“一次申报，一次查验，一次放行”）、运输工具登临检查、辐射探测、邮件监管、快件监管、报关报检企业资质注册以及对外“一个窗口”办理等业务领域完成优化整合，实现“一口对外、一次办理”，并完成业务单证及印章的统一替换。